Genómica


Extração, purificação, sequenciação e seleção de tamanho de ácidos nucleicos, análise genética com novas e exclusivas tecnologias de deteção e contagem de moléculas, tanto de ácidos nucleicos como de proteínas através do uso de sondas marcadas com um código de barras de cores.

Izasa Scientific, oferece soluções completas no campos de Ciências da Vida.
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nCounter® Vantage 3D™ Immune Assays

A tecnologia de Nanostring alargou-se também à deteção de proteínas através da marcação de anticorpos específicos com o barcode de cores.

Estes anticorpos seriam os que reconheceriam especificamente a proteína, de tal maneira que no final, para a sua quantificação, a sonda reporter com o barcode de cores se separaria do anticorpo, ficando livre para proceder à união ao cartucho e posterior leitura.

A deteção de proteínas com esta metodologia relaciona-se fortemente com ensaios de citometria de fluxo (R2>0.75)

O conceito de 3DTM Biology patenteado por NanoString tornou esta tecnologia numa das classificados pela revista The Scientist nol Top 10 das inovações de 2016.

We are thrilled to announce that we are a winner for The Scientist Top 10 Innovations 2016 Award

Nanostring permite a quantificação simultânea e na mesma amostra de proteínas e genes de expressão, fazendo uso da mesma tecnologia com os nCounter® Vantage 3D™ Immune Assays. Estes ensaios estão desenhados para misturar os paineis de PanCancer com os paineis de deteção de proteínas à escolha do investigador.

  • A partir de 20.000 células (50.000 células para PBMCs e células primárias).
  • Não necessita de assistência de pessoal bioinformático, graças ao software gratuito de análise avançada do nSolver.
  • Desenho flexível: permite personalizar o painel através da adição de 3 proteínas à escolha do investigador através do serviço que oferece NanoString Vantage 3D™ Protein Barcoding Service.

 

RNA:Protein Immune Cell Profiling

Para analisar o mRNA e as proteínas de superfície celular como recetores, marcadores de linhagem celular, moléculas reguladoras para monitorizar alterações na abundância de um determinado tipo celular e seu status de ativação.

 

RNA:Protein Immune Cell Signaling

Mede o mRNA e os níveis de determinadas proteínas intracelulares como as citoquinas, quimoquinas e fatores de transcrição  implicados em estados iniciais de comunicação celular e diferenciação imune.

 

Immune Cell Profiling Protein

Stage of Cancer Immunity Cycle

Associated Proteins

(2) Antigen presentation CD4, CD40, CD40L
(3) Priming and activation PD-1, PD-L1, PD-L2, IL2R, NCAM, GITR, OX40, CD27, CD28, CD127, CD137
(4-5) Trafficking and infiltration CD9
(6-7) Recognition of and killing cancer cells PD-1, PD-L1, PD-L2, BTLA, HLA-DRA
Immune modulation PD1, ICOS, KIR3DL1, NKp46, CTLA-4, DE3E, CD8A, CD14, CD19, CD33, CD68, CD163, CD45RO, NT5E

 

Immune Cell Signaling Protein

Immunologic Role

Associated Proteins

Chemokines CCL5, CXCL5, CXCL8
Cytokines IL-1B, IL-10, IL-12p40, IL-2, IL-6, TFGB
Transcription Factors Aiolos, BaF, FoxP3, GATA3, Helios, Ikaros, STAT1, STAT3, T-bet, Th-Pok, IRF4, Bcl-6
Additional Immune Functions IDO, GM-CSF, IFNy, Perforin, IL-15RA

 

nCounter® Vantage 3D™ Solid Tumor Assays

Nanostring permite também a deteção de SNVs (Single Nucleotide Variations) a nível de DNA através da tecnologia do barcode de cores..

Consegue-se através da deteção de presença/ausência de um determinado SNP numa região já conhecida através da união ou não união de uma sonda específica desenhada para a sua hibridação.

 

DNA SNV Solid Tumor Panel 

Permite monitorizar 104 SNVs e INDELS (inserções e deleções) presentes frequentemente em determinados tumores.

A partir de 5 ng de DNA, 25 ng de RNA e 250 ng proteínas ou 2 portas de 2 amostras parafinadas FFPE. A deteção de SNVs requer pre-amplificação prévia à hibridação.

Com a tecnologia patenteada de 3DTM Biology, e em combinação com os nCounter Vantage 3D RNA:Protein Assays, pode-se analisar e validar mutações de DNA juntamente com a expressão génica e de proteínas na mesma amostra ao mesmo tempo.

NanoString oferece diferentes protocolos segundo o tipo de amostra de partida

  • RNA:Protein Solid Tumor Assay for Lysate 
  • RNA:Protein Solid Tumor Assay for FFPE
  • DNA:Fusion Lung Assay . Combina o painel de SNVs com o de lois genes de Fusão para pulmão.

 

nCounter Vantage 3D Workflow, NanoString Technologies, Inc.
 

 

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