Genómica


Extração, purificação, sequenciação e seleção de tamanho de ácidos nucleicos, análise genética com novas e exclusivas tecnologias de deteção e contagem de moléculas, tanto de ácidos nucleicos como de proteínas através do uso de sondas marcadas com um código de barras de cores.

Izasa Scientific, oferece soluções completas no campos de Ciências da Vida.
Genómica | Izasa Scientific
Nanostring_GenesFusão_IzasaScientific

Genes de fusão

Um gene de fusão num gel híbrido formado pela união de dois genes independentes.

Este fenómeno pode ocorrer como resultado de uma traslocação, deleção ou inversão cromossómica. A sua deteção é usada principalmente como diagnóstico de certos tumores.

NanoString carateriza simultâneamente estes eventos de fusão génica. Para isso, utiliza sondas de união projetadas para cada caso particular.

Produtos

1. Vantage Gene Fusion panels

os paineis de Genes de Fusão Vantage utilizam um ou mais sondas patenteadas: Junction Probes ou 5’/3’ Positional Imbalanced Probes.  Estes desenhos permitem detetar especificamente as regiões formadas pela sequência resultante da fusão.

No caso das Junction Probes, a especificidade consegue-se através de uma sonda adicional, a sonda protetora, para criar um balanço termodinâmico que assegure que o sinal apena se gera na presença da hibridação perfeita na sequência alvo. descartando assim o background típico presente nos tecidos.

 

nCounter Vantage™ Gene Fusion Panels: Junction Probe Designs
 

As sondas 5’/3’ Positional Imbalanced utilizam-se principalmente em alguns casos nos quais os eventos de fusão génica compara a relação entre a expressão génica em ambos lados da zona de união. Cada gene que contribui para a fusão deve ter promotores com diferentes forças ou atividade, o que afetará diferencialmente a expressão dos exões localizados em 5´ou em 3´da zona de união. Uma relação de expressão de 5´/3´ divergente de 1 significa que ocorreu uma fusão. Este tipo de sondas utilizam-ase principalmente para o estudo de novos eventos de fusão ou para confirmar eventos detetados através de sondas de união (Junction Probes).

Fusion Genes - 5'/3' Imbalance Designs
 

 

1.1 nCounter® Lung Fusion Panel

O paunel nCounter® Lung Fusion inclui 63 sondas: 35 para fenómenos específicos de fusão (Junction probes), 24 para deteção de expressão génica de desequilíbrio posicional (Imbalance probes) e 4 genes de referência internos.

 

Sondas específicas de união para pulmão:

ALK

RET

ROS

NTRK1

EML4-ALK

CCDC6-RET

CD74-ROS1

CD74-NTRK1

HIP1-ALK

KIF5B-RET

EZR-ROS1

MPRIP-NTRK1

KIF5B-ALK

 

GOPC-ROS1

 

TFG-ALK

 

LRIG3-ROS1

 

TPR-ALK

 

SDC4-ROS1

 

 

 

SLC34A2-ROS1

 

 

 

TPM3-ROS1

 


 

Sondas de desequilíbrio posicional (Imbalance probes) para pulmão:

ALK

RET

ROS

8 probes

8 probes

8 probes

 

1.2 nCounter® Vantage Leukemia Fusion Panel 

O painel nCounter® Leukemia Fusion inclui 42 sondas no total: 27 para fenómenos específicos de fusão (Junction probes), 12 genes de leucemia e 3 referências internas.

 

Sondas específicas de união para leucemia:

CML

ALL

AML

AML/APL

BCR-ABL

E2A-PBX1

AML-ETO

PML-RARA

 

MLL-AF4

CBFB-MYH11

 

 

TEL-AML1

DEK-NUP214

 

 

 

RPN1-EVI1

 

 

Sondas específicas para genes de leucemia:

Genes for AML, CML and ALL

BAALC

ERG

FLT3

MECOM

MLLT11

MN1

NRAS

PRAME

RB1

SOCS2

TP53

WT1

 

2. Paineis personalizados de genes de Fusão

 

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