Como productos últimos de los genes expresados en un determinado contexto, nos encontramos las proteínas, con sus funciones reguladoras, o estructurales, y por supuesto enzimáticas. No es suficiente conocer los patrones de expresión de un determinado gen, necesitamos saber cómo y donde aparece el producto que codifica, y como afecta esto al metabolismo celular y a nivel de individuo.

Ha sido necesario un importante desarrollo técnico para poder trabajar con cantidades ínfimas de estos productos (proteínas, metabolitos) que no se pueden amplificar, y que en ocasiones son difíciles de identificar o cuantificar. Hoy se abre un futuro fascinante en este sector.