Históricamente, la Citometría de Flujo ha implicado el análisis de fenotipo celular, a nivel de población, más que a nivel unicelular. Por tanto, el análisis genético de poblaciones separadas por sorting, utiliza los valores medios de poblaciones heterogéneas.

Debido a la heterogeneidad celular, incluso entre células aparentemente idénticas, y a la necesidad de determinar marcadores moleculares, hay un creciente énfasis en el desarrollo de métodos para el estudio de células a nivel unicelular. El reciente análisis de ARN (RNA-seq) a nivel unicelular está proporcionando información fundamental para discernir y perfilar la variabilidad de célula a célula a nivel genómico.

Para poder llevar estos estudios a gran escala y con valor estadístico, es necesario realizar estos análisis a nivel high throughput. La metodología de sorting, es uno de los mejores métodos, debido a la gran cantidad de células que se pueden separar a alta velocidad, en base a diferentes marcadores biológicos.

Hasta la fecha, el hándicap de la técnica de sorting ha sido el requerimiento de técnicos especializados y con gran experiencia para realizar los ajustes ópticos y de fluídica de los equipos.

Para evitar pérdidas durante el proceso de purificación de ARN, se deben emplear volúmenes mínimos. Por este motivo, es fundamental la precisión de la posición de sorting en cada pocillo de la placa.

El Sorter SH800 de Sony tiene varias características que lo hacen idóneo para esta aplicación. Es un sistema completamente automatizado, emplea chips de microfluídica, con diversos tamaños de nozzle, para el empleo de células de diverso tamaño. Todos los componentes de fluídica son intercambiables por el usuario, para controlar la presencia de nucleasas tales como RNasa y asegurando la integridad de la muestra.