COVID-19

Búsqueda de soluciones a la COVID-19 con Tecnologías de Vanguardia


Estrategia Epidemiológica


SH800

Sorting automático

La complejidad de tipos celulares ha supuesto históricamente una dificultad para diseccionar fenómenos como la respuesta inmune, o la evolución de poblaciones en un proceso oncológico. La separación celular por citometría de flujo (“sorting”) es la técnica estándar, siempre que dispongamos de marcadores adecuados para diferenciar estas subpoblaciones. El objetivo puede ser tanto conseguir un numero suficiente de células vivas de una subpoblación homogénea, como la separación de “celuas únicas”, tanto par clonaje, como para el descubrimiento de biomarcadores utilizando técnicas de secuenciación de célula única (por ejemplo en combinación con el equipo C1 de Fluidigm)

Los separadores celulares (sorters)  de SONY, han sido diseñados para simplificar el uso de la técnica, con una calidad de resultados equiparables a los equipos más sofisticados existentes en el mercado.

Ajustes del equipo totalmente automatizados.
La tecnología del SH800 incorpora los ajustes de alineado de láser, formación de gota, cálculo de "drop delay" y chorros laterales totalmente automatizados, evitando el requerimiento de un técnico especialista para preparar los ajustes óptimos de trabajo para cada aplicación de interés.

Equipo compacto, y flexibles, lo que permite su instalación en laboratorios de seguridad biológica, o entornos GMP

Puede albergar de uno a cuatro láseres y cuenta con 6 canales de detección de fluorescencia, los cuales se pueden asociar a cualquiera de los láseres libremente.

Helios / Hyperion

Citometría de masas de alto nivel de multiplexado

¿Cómo reacciona el sistema inmune ante un agente infeccioso, un tumor, un alérgeno…? La extraordinaria complejidad de tipos celulares e interacciones, en ocasiones con la presencia de poblaciones tan minoritarias como importantes, solo puede resolverse con técnicas de muy alto nivel de multiplexado.

La citometría convencional tiene dos limitaciones. La primera es el número de marcadores simultáneos a ensayar, y la segunda, es la necesidad de trabajar con suspensiones unicelulares, por lo que pierde la información espacial de los diferentes fenotipos presentes en un tejido.

La citometría de flujo acoplada a espectrometría de Masas  CyTOF, supera las limitaciones de la citometría convencional, basada en fluorescencia, con los problemas de solapamiento de los espectros de emisión, y por tanto la limitación en el diseño de paneles, y en el número de marcadores simultáneos a analizar. El efecto practico es la dificultad de interpretar muestras muy complejas de células, caracterizadas por la expresión de múltiples biomarcadores.

En lugar de separar señales en función de diferencias de longitud de onda, las separa según diferencias de masa. Emplea anticuerpos conjugados a metales, con una resolución de 1 dalton, y un detector de 135 canales. Esto supone un marcaje mucho más uniforme, sin diferencias de intensidad de señal entre marcadores, sin señal de fondo, y sin el requerimiento de controles para cada canal, aportando muchísima más información por célula.

Al poder combinar todos los parámetros en un único tubo, el requerimiento de células es mucho menor, facilitando el análisis de muestras de valor clínico.

Para abordar el segundo problema de la citometría clásica, Fluidigm acopla un sistema de imagen para citometría de masas (Helios), llevando el análisis de imagen de secciones de tejidos a nivel multi-paramétrico sin precedentes en ninguna tecnología existente, con capacidad de más de 50 parámetros, y una resolución de 1 micra. Esto supone una auténtica revolución en el análisis de imagen, hasta la fecha imposible.

Biomek i5

Sistema automatizado de manejo de líquidos con 1 brazo de pipeteo y 1 gripper

Optimizando al máximo eficiencia y tiempos de trabajo a la hora automatizar los procesos de preparación y manipulación de muestras. Incremento de la productividad y el número de muestras a procesar, seguridad para muestras y operadores y trazabilidad del proceso en condiciones GMP.​

  • Para proyectos de automatización desde medias a elevadas capacidades de procesamiento de muestras sin intervención del usuario
  • Mesa de trabajo con 25 posiciones para pipeteo, posicionamiento o acción de dispositivos integrados.
  • Rango de pipeteo de  0.5 - 5,000 µL
  • Modelos de 1 brazo de pipeteo, incluyendo gripper, ya sea con cabezal Span-8 o cabezal Multicanal.
  • Variedad de tamaños, capacidades de plataforma y funcionalidades generales.

Diferentes configuraciones le permiten optimizar el rendimiento y reducir el tiempo de intervención manual para la mayoría de los flujos de trabajo en genómica, descubrimiento de fármacos  y vacunas, aplicaciones de investigación básica.

Juno

Preamplificación, genotipado de SNPs y preparación de librerías para NGS en un solo proceso automatizado

Cuando es necesario procesar grandes colecciones de muestras como es el caso de los estudios epidemiológicos o la selección de variantes génicas, el “cuello de botella” comienza en la preparación de muestras.

Genotipado masivo por cuantificación de SNPs mediante PCR específica de alelo, expresión génica, preparación de librerías de ADN para Next Generation Sequencing´.

  • Bajos volúmenes de reactivos y muestras, reducida mano de obra. Objetivo, incrementar la productividad, evita el problema de disponibilidad de reactivos limitantes y reducir tiempo de ejecución del proyecto, minimizando el coste.
  • Este equipo permite generar de docenas a cientos de bibliotecas preparadas para NGS en un solo paso en placas IFC de 48 ó 192 muestras.
  • Paneles de diseño rápido fácil y flexible, para proyectos NGS específicos, genotipado de SNP o expresión génica para, detectar variantes de ADN, ARNm o miARN, desde unas pocas, hasta varios miles de muestras al día.

 

 

Sistema C1

Solución automatizada para la genómica de célula única

El descubrimiento de biomarcadores, la respuesta celular en condiciones tanto normales como patológicas o en general, el conocimiento del funcionamiento de un organismo como conjunto, requiere del estudio de múltiples células individuales. Los estudios genómicos de célula única se están imponiendo como la herramienta clave en este proceso.

La combinación de técnicas de enriquecimiento, como la separación por citometría de flujo, junto con el empleo de sistemas microfluidicos como el C1, facilitan una solución automatizada para los estudios genómicos a nivel de célula única.

Este equipo nos permite preparar las muestras para análisis de secuenciación de mRNA, secuenciación de ADN, epigenética o expresión de miRNA a nivel de célula individual, lo que se conoce como “single cell sequencing”

  • El C1 permite analizar las diferencias en poblaciones celulares heterogéneas
  • Aísla y procesa fácilmente células individuales en el circuito fluidico integrado (IFC)
  • Permite la preparación de muestras para el análisis de secuenciación de mRNA, secuenciación de ADN, epigenética o expresión de miRNA
  • Ofrece la posibilidad de crear tus propias aplicaciones con Script Hub
  • Minimiza el tiempo de trabajo con flujo automatizado que permite mayor reproducibilidad de datos

BIOMARK HD

Estudios de poblaciones, estudios epidemiológicos, selección de variantes con el mínimo coste. Detección de SARS-CoV2 a partir 12 ul de saliva y sin extracción previa de RNA, con uso de un kit RUO.

Hay situaciones en las que es necesario testar grandes poblaciones, para múltiples factores génicos. Desde los estudios epidemiológicos (tanto en salud humana como agropecuaria), a la selección de variantes, se caracterizan por la necesidad te testar miles de individuos en plazo corto, y con el mínimo coste en reactivos caros. Los tres factores limitantes son: alta productividad y flexibilidad con bajo volumen de muestra

BIOMARK HD – Es una plataforma de análisis genéticos que utiliza una tecnología única basada en microfluidica integrada en circuitos internos (IFC), que da lugar a resultados de alta calidad, con gran robustez, alta reproducibilidad y escalabilidad, siendo uno de los sistemas más potentes para trabajos de análisis que requieran “High Troughput”.

Productividad: gracias a la microfluidica integrada, un sistema Biomark puede analizar más de 6.000 muestras al día, analizando hasta 24 parámetros por muestra, pudiendo generar hasta 150.000 reacciones diarias, lo que representa un procesamiento y escalabilidad imposibles de alcanzar con las técnicas actuales basadas en microplaca. Detección de SARS-CoV2 a partir 12 ul de saliva y sin extracción previa de RNA, con uso de un kit RUO.

Flexibilidad: sistema de química abierta, compatible con las principales tecnologías (Taqman, Eva Green, SYBR), y paneles de expresión génica totalmente personalizables, ideal para el estudio de mutaciones en campos como la oncología, o análisis de patógenos de rápida evolución

Versatilidad: esta plataforma puede ser utilizada para multitud de aplicaciones, como: expresión génica, genotipado, variación de número de copias (CNV), detección de mutaciones puntuales (SNPs), PCR digital (cuantitativa), o cuantificación de proteínas (tecnología Olink).

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