Simplificar para compreender é uma estratégia que requer separar e purificar os diferentes tipos de células que compõem um sistema, ou os seus organelos e estruturas subcelulares.

Os procedimentos de separação, purificação e fracionamento de células e organelos são normalmente realizados com base nos processos físicos, como diferentes tipos de centrifugação, que aproveitam as diferenças de densidade.

Também podem ser realizados por processos mecânicos que aproveitam diferenças morfológicas ou funcionais, como a expressão de marcadores, como é o caso da disseção a laser, micromanipulação ou separação por citometria de fluxo (sorting).